その昔「魔笛士」が世を統治していた時代。
魔力を込めて吹いた笛の不思議なメロディは、魔物たちをたちまち一掃したという。
「魔笛士」の存在は平和をもたらし、人々に笑顔を取り戻したー。

しかし時は巡り、鳴りを潜めていた魔物たちが、
勢力を蓄え、再び世界征服に乗り出さんとしているという。
それを知った各地の「魔笛士」たちは呼びかけあい、来る大戦に備えて集いつつあった。

魔物との戦いを許された一流の「魔笛士」になるには、四季の山々の祠を訪れ、
そこに祀られている「秘伝譜」と呼ばれる伝説の曲が記された楽譜を手に入れる必要があった。

時を同じくして、山頂の村に住むひとりの青年が、新しい冒険の旅立ちを決意しつつあった。
彼は世の平安のため、また己の力試しのために一流の「魔笛士」を目指すのだった…。